融合改进UNet和迁移学习的棉花根系图像分割方法(《智慧农业(中英文)》2023年第3期)

引用格式:唐辉,王铭,于秋实,张佳茜,刘连涛,王楠.融合改进UNet和迁移学习的棉花根系图像分割方法[J].智慧农业(中英文),2023,5(3):96-109.

DOI:10.12133/

TANGHui,WANGMing,YUQiushi,ZHANGJiaxi,LIULiantao,ng[J].SmartAgriculture,2023,5(3):96-109.

DOI:10.12133/

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融合改进UNet和迁移学习的棉花根系图像分割方法

唐辉1,王铭2,于秋实1,张佳茜1,刘连涛3,王楠1*

(1.河北农业大学机电工程学院,河北保定071001,中国;2.河北省教育考试院,河北石家庄050091,中国;3.河北农业大学农学院,河北保定071001,中国)

摘要:

[目的/意义]根系是植物组成的重要部分,其生长发育至关重要。根系图像分割是根系表型分析的重要方法,受限于图像质量、复杂土壤环境、低效传统方法,根系图像分割存在一定挑战。

[方法]为提高根系图像分割的准确性和鲁棒性,本研究以UNet模型为基础,提出了一种多尺度特征提取根系分割算法,并结合数据增强和迁移学习进一步提高改进UNet模型的泛化性和通用性。首先,获取棉花根系单一数据集和开源多作物混合数据集,基于单一数据集的消融试验测试多尺度特征提取模块(Conv_2+Add)的有效性,与UNet、PSPNet、SegNet、DeeplabV3Plus算法对比验证其优势。基于混合数据集验证改进算法(UNet+Conv_2+Add)在迁移学习的优势。

[结果和讨论]UNet+Conv_2+Add相比其他算法(UNet、PSPNet、SegNet、DeeplabV3Plus),mIoU、mRecall和根系F1调和平均值分别为81.62%、86.90%和78.39%。UNet+Conv_2+Add算法的迁移学习相比于普通训练在根系的交并比(IntersectionoverUnion,IoU)值提升1.25%,根系的Recall值提升1.79%,F1调和平均值提升0.92%,且模型的整体收敛速度快。

[结论]本研究采用的多尺度特征提取策略能准确、高效地分割根系,为作物根系表型研究提供重要的研究基础。

关键词:深度学习;根系图像分割;UNet;多尺度特征;迁移学习

图1单一数据集棉花根系图像获取装置

图2单一数据集棉花局部根系标注示例

图3模型训练的原始图像及4种不同的数据增强方法结果

hancementmethods

图4改进UNet模型的整体结构

图5根系分割算法研究技术路线

图6根系图像分割消融实验各种改进模型的损失

mentation

图7对比试验的各模型分割结果图像

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图8对比试验的各模型对比结果细节小图

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图9改进模型(UNet+Conv_2+Add)和原始模型在普通训练和迁移学习下的损失

(UNet+Conv_2+Add)andtheoriginalmodelunderordinarytrainingandtransferlearning

图10改进模型(UNet+Conv_2+Add)的迁移学习分割结果

(UNet+Conv_2+Add)

王楠副教授

王楠,河北农业大学机电工程学院,副教授。从事机器视觉、图像处理及模式识别方面的研究,主持省部级科研课题2项,参与国家级项目3项,近年发表学术论文10余篇。










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